Après le Christianisme, l'Islam introduit en 642 est devenu la religion officielle (90% de la population).
Ainsi vous entendrez les 5 appels à la prière du muezzin perché sur son minaret.


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Parmi les minorités on peut citer les Coptes : une religion égyptienne et éthiopienne qui professe le monophysisme, une doctrine affirmant l'union du divin et de l'humain dans le Christ en une seule nature. L'un des plus fervents représentants est Boutros Boutros Ghali.
Cette religion cohabite avec l'Islam mais les mariages interreligieux restent interdits.
Le gouvernement d'Hosni Moubarak tente de se protéger des courants islamiques extrémistes qui prennent généralement pour cible les chrétiens afin de déstabiliser le régime.